Возможные нежелательные реакции при применении Клиндацина включают местные проявления. Очень часто (более 10%) возникает вульвовагинальный кандидоз. Часто (1-10%) отмечаются головная боль, головокружение, нарушение вкуса, инфекции верхних дыхательных путей, боли в животе, запор, диарея, тошнота, рвота, кожный зуд, сыпь, боли в спине, инфекции мочевыводящих путей, глюкозурия, протеинурия, вульвовагинит, нарушение менструального цикла, боли во влагалище, маточные кровотечения, выделения из влагалища. Нечасто (0,1-1%) - вертиго, носовые кровотечения, вздутие, метеоризм, крапивница, эритема, дизурия, трихомонадный вульвовагинит, вагинальные инфекции, боли в тазу, местные реакции в месте введения. Частота неизвестна - псевдомембранозный колит, гипертиреоз, кандидоз кожи, эндометриоз.