Механизм действия борной кислоты основан на коагуляции белков, в том числе ферментных, микробной клетки, а также на нарушении проницаемости клеточной оболочки. Это приводит к гибели или задержке роста и развития микроорганизмов. Так, 2-4% раствор задерживает рост и развитие бактерий, а 5% водный раствор ингибирует процессы фагоцитоза. Препарат абсорбируется через поврежденную кожу, раневую поверхность, слизистые оболочки, а при приеме внутрь - через желудочно-кишечный тракт. Борная кислота проникает во многие органы и ткани и может в них накапливаться. Выводится медленно, при повторных введениях кумулирует. Около 50% выделяется с мочой за 12 часов, остаток - в течение 5-7 дней. Обладает раздражающим действием на слизистые оболочки и грануляционные ткани. Всасываясь, вызывает системные токсические эффекты. У детей раннего возраста особенно хорошо проникает через кожу и слизистые оболочки, что может приводить к тяжелым последствиям, включая смертельные исходы при случайном приеме внутрь или нанесении на поврежденную кожу. При повторном поступлении в организм ребенка, например после грудного кормления при обработке борной кислотой молочной железы, могут развиться нарушения функции почек, метаболический ацидоз, гипотония.